จริงๆแล้วแม่น้ำเจ้าพระยาไม่ได้เกี่ยวข้องกับเจ้าพระยาคนไหนเลยแต่ที่ทีมาจากชื่อสถานที่ที่แม่น้ำไหลผ่าน สมเด็จกรมพระยาดำรงราชานุภาพทรงเขียนไว้ในราชพงศาวดารฉบับพระราชหัถเลขว่า "ที่เราเรียกปากน้ำเจ้าพระยากันทุกวันนี้"  แต่โบราณเรียกปากน้ำพระประแดง
 
ภายหลังเมื่อแผ่นดินงอกทะเลหางออกไปไกลเมืองพระประแดง จึงเรียก ปากน้ำบาง
เจ้าพระยาในสนธิสันญาที่ไทยได้ทำกับฝรั่งเศษ ครั้ง ม.ลาบูแบร์  ในราชการสมเด็จพระนารายมหาราช จึงเรียกแม่น้ำสายนี้ว่า  "แม่น้ำบางเจ้าพระยา" 

ในสมัยต่อมา ม.ร.ว. ศึกกฤทธิ์    ปราโมช  เขียนไว้ในคอลัม  ข้าวไกลนา  หนังสือพิมพ์สยามรัฐฉบับวันที่ 30 มิถุนายน 2520  ว่าแม่น้ำเจ้าพระยาเริ่มต้นที่จุดรามของแม่น้ำน่านและแม่น้ำปิงที่ปากน้ำโพจังหวัดนครสวรรค์ ไปสิ้นสุดไหลออกทะเลปากน้ำเมืองสมุทรปราการ ตรงที่แม่น้ำนี้ไหลออกทะเลนั้น เคยมีชื่อ ว่า  เจ้าพระยา ชื่อตำบลนั้น ก็เลยใช้เรียกชื่อแม่น้ำทั้งสายว่า  แม่น้ำเจ้าพระยา  เช่นเดียวกับเอาชื่อตำบลที่แม่น้ำสายอื่นๆไหลผ่านออกสู่ทะเลเป็นชื่อแม่น้ำ  เช่น แม่น้ำบางประกง  แม่น้ำท่าจีน  แม่น้ำกลอง เป็นต้น